Этого недостаточно?:) У каждого свои бизнес-процессы, может вам там на этих 5 машинах AD и вовсе не нужен? Ну, если вас не беспокоит недоступность ресурсов сети...
Возвращаемся к топику:
В микротике можно прописать статические данные в настройках DNS. Попробуйте свои контроллеры туда вписать, аккуратненько, со всеми суффиксами. Всю сеть вписывать глупо, конечно, но вам-то скорей всего пару хостов надо...
Есть еще мысль - порыть в сторону какой DNS первичный у микрота и менять его когда восстанавливается канал до центрального офиса. Но я что-то даже не могу навскидку представить как.
