В свое время были такие проблемы - перешли на ipfw nat.
Но проблемы порой знали о себе знать, только немного в другом обличии. Проблему решили - сейчас самому интересно сработает ли, но попробуйте и обязательно отпишитесь о результате:
Добавьте в правило фаервола
00011 382711287 27928042812 deny ip from any to any dst-port 6881
это стандартный порт обмена DHT у торрентов
может достигать умопомрачительный чисел для процессора запросов на соединение и ждать ответа.
P.S. В последних версиях торрент клиентов видимо также появилась возможность использовать другие порты для DHT.
Ребята нашли решение в пересборке libalias с меньшими временами поддержания соединения.
