Была похожая ситуация при обновлении до 3.4.5, но:
1) в момент возникновения проблем со списанием/выставлением инвойсов ( как правило, в ночь на первое число ) - саппорт реагировал сравнительно быстро, и критичные проблемы устранялись/обходились сразу.
2) перед обновлением боевого билинга - просите обновить тестовый инстанс БД, и гоняйте его 1-2 месяца. Мы вот на четверку совсем не спешим переходить, пока хотя бы половина их клиентов на неё не перелезла :)
Вообще, бездумное обновление без тестирования чревато в случае любого билинга - что с гидрой за лям+, что с утмом почти забесплатно
