Есть вариант и реально мне помогал, если с двух сторон до микротов, которые работают по воздуху, поставить простые писюки с юниксом и загонять всю лабуду торентовую и прочую в ipip тунель (именно не на самих микротах).
Выйгрышь в том, что ресурсы "connection tracking" микрота не будут расходоваться, потому как он будет видеть только одно соединение между двумя писюками с юниксом.
Дополнительно, если на юниксах (а там без особых проблем) использовать вместо ipip тунеля VTun, позволяющего не хило сжимать трафик, отсюда меньшая загрузка радио-канала на микротах.