Если бы сам мог самостоятельно решить проблему, не стал бы просить на форуме.
Ну ладно, получается:
1. Допустим имеется порт на Cisco 3750, настроенный на native vlan 999 (inter vlan 999 ip address 172.31.0.1/24).
2. Также имеется порт на Cisco 3560, настроенный на native vlan (inter vlan 999 ip address 172.31.0.11/24).
3. Назначаю адреса
а) 172.31.0.2 порту на Mikrotik1;
б) 172.31.0.12 порту1 на Mikrotik2;
в) 172.31.0.13 порту2 на Mikrotik2;
г) 172.31.0.14 порту3 на Mikrotik2.
4. Прописываю на 3750 статичные маршруты до удаленных сетей через 172.31.0.2
5. Прописываю на 3560 статичные маршруты до сетей центрального офиса через 172.31.0.14
6. На Mikrotik2 создаю основной (172.31.0.12) и резервный (172.31.0.13) маршруты.
...
Ну и далее не совсем понятно.
А как-нибудь можно сделать, чтобы было все просто: как бы Cisco подключены тракновым портом, но между ними Mikrotikи, которые устанавливают приоритет трафика проходящего через них.