---------------
Была такая же проблема, решил с помощью параметра cburst, вот мой рабочий пример модуля shaper.
Попробуй думаю поможет.
[shaper]
#attr=Filter-Id
down-burst-factor=0.1
up-burst-factor=1.0
#latency=50
#mpu=0
#mtu=0
r2q=12
quantum=1500
#moderate-quantum=1
cburst=306800
ifb=ifb0
up-limiter=htb
down-limiter=htb
leaf-qdisc=sfq perturb 10
#leaf-qdisc=fq_codel [limit PACKETS] [flows NUMBER] [target TIME] [interval TIME] [quantum BYTES] [[no]ecn]
#rate-multiplier=1
#fwmark=1
attr-down=PPPD-Downstream-Speed-Limit
attr-up=PPPD-Upstream-Speed-Limit
verbose=1
-----
Атрибуты значений лимита скорости канала, которые передаются от radius.
attr-down=PPPD-Downstream-Speed-Limit
attr-up=PPPD-Upstream-Speed-Limit
-----
Так-же отключи tco и gso на eth интерфесах.
ethtool -K eth0 gso off
ethtool -K ethX tso off
и после проверь, выключились ли они.
После чего заходим в управление accel-ppp telnet 127.0.0.1 2000 и делаем команду reload, выходим из терминала управления accel-ppp, переподключаешь сессию, profit.